[NickM]

почему программа не запускалась через автозагрузку или редактор реестра. Что это у Windows за выборочность? Почему некоторые приложения запускаются, а некоторые нет? »

По той причине, что "techpowerup-throttlestop" требует повышенных прав и автозапуск с правами обычного пользователя Вам не позволит запустить эту программу.
Автозапуск программ может быть разный, и через планировщик задач, и через службы и пр.

Я запускаю просто двойным нажатием, не через правую кнопку и запуск от имени администратора. »

Скорее всего у Вас отключён UAC;

Конкретно данная программа не запускается никак. Не пойму в чем дело. »

Мне удалось запустить через планировщик задач по этой инструкции: »

Всё верно, в той инструкции как раз и говорится о предоставлении повышенных прав на запуск задачи;

Из названия понятно, что это гадость. »

Да вроде утилита от нормального разработчика?