[Iska]

А в случае если по одной из жестких ссылок файл будет меняться, то изменится и оригинал? »

vasya00, при использовании жёстких ссылок нет понятия «оригинал» — любая из «жёстких» ссылок файла и есть оригинал. Чтобы Вам было понятнее — любой файл всегда имеет одну «жёсткую» ссылку. А так, да — изменится: редактирование содержимого файла по любой из его жёстких ссылкок приведёт к изменению содержимого файла.

А нет возможности в этом случае делать копию? »

Можно. Обычным образом копируете файл — вот Вам и копия.

Соответственно третье может меняться в процессе работы, не хотелось чтобы это отразилось на 1 и 2.. »

Ну, так Вы определитесь, нужно Вам сокращение используемого пространства за счёт удаления дубликатов файлов и замены их на жёсткие ссылки или нет.