[vadblm]

Имеет ли смысл нацеливаться сейчас на SATA 3? »

Нет.

если на винчестер с SATA 3 поставить ОС, то производительность системы вырастет, т.к. увеличиться скорость обмена данными. »

Не вырастет сколько-нибудь заметно. Увеличивается не скорость обмена данными, а пропускная способность интерфейса.

На этом форуме любят автомобильные аналогии - допустим, в гипотетической стране Спидляндии было ограничение на скорость передвижения 300км/ч. В Спидляндии все ездят на спорткарах, некоторые из которых способны развивать скорость выше 300км/час, скажем 305. А под горку - все 350! Чтобы не ущемлять гражданские права их владельцев, доброе правительство подняло скоростную планку сразу до 600км/ч.

Да, уже есть довольно широкий выбор жестких дисков с интерфейсом SATA III, только вот производительность их вовсе не увеличилась скачком, даже лучшие диски не то что не шагнули за предел SATA II, но даже близко к нему не подобрались.
SATA III на упомянутых дисках даёт лишь мизерный прирост производительности за счёт более быстрой работы в случае попадания запростов в дисковый кэш. Практическая польза от SATA III может сегодня наблюдаться только при использовании топовых SSD накопителей, которые, прямо скажем, не для бюджетного решения.