[ineXPert]

Я тоже когда поставил IE10 на системник через Windows Update, а потом зашел на vk.com то сверху страницы вылезло предупреждение, что я пользуюсь браузером, который не может нормально работать с этим сайтом, и vk.com предложил мне воспользоваться одним из альтернативных браузеров: firefox, chrome, opera, safari.
Правда на следующий день когда я зашел на тот же сайт, такого предупреждения уже не было..

[LehaMechanic]

Но вопрос остался в силе. Почему это произошло? »

При первом запуске любой свежеустановленной программы происходит её начальная настройка, инициализация - назовите как хотите - выполняются какие-то служебные записи в реестр, создание рабочих файлов, конфигурирование и т.д.
Возможно и здесь такая же ситуация, плюс потребовался перезапуск программы, чтобы изменения вступили в силу. А до тех пор сайт не смог правильно определить, что же за браузер перед ним.