[freese]

могу ли я залить утилитой netinstall.exe на rb951-2n(mipsbe) файлы: protected_routerboot_v3_41_enable_6_40_mipsbe.dpk »

нет, написано же v3_41. Вот если откатитесь до 6.40 и перешьете fwf на 3.41, другой вопрос.
Что вам мешает так установить пакеты?

[sngua]

freese,
Благодарю за отзывчивость и внимание , решил всё с помощью Winbox стандартными средствами MikroTik . netinstall используют в основном для восстановления работоспособности после неудачной прошивки , вот и натолкнуло на мысль что утилита тупо перешивает весь ром с загрузчиком при определённых настройках и содержимое не имеет значения .