[El Scorpio]

Вопрос: почему у вас на диске №2 отсутствует резервный раздел 100 МБ ?

Главный вопрос: вы хотите просто перенести систему на другой диск (массив дисков) или же хотите скопировать систему на другой компьютер?
Если требуется просто перенести, то можно.
Даже будет лучше сначала добавить в массив новые диски, а потом отключить старые.

[andragen]

на диске 2 нет загрузочной копии на 100мб потому что я видимо не делал для раздела с 100мб на диске 0 копию.
Сейчас я выкинул с зеркала диск 2 затем сперва сделал зеркало для раздела в 100мб на диске 4 а сейчас делаю зеркальную копию на диске 4 для раздела диска С с диска 0
После окончания выкину с зеркала диск 0 и добавлю в зеркало диск 1

Но есть опасения что после ребута может не загрузится винда и вот от куда опасения в статье http://habrahabr.ru/company/first/blog/241333/ в коментах написано что нужно запустить команду «bcdboot c:\windows /s c:» и она скопирует системные файлы на 2-й диск. В моем случае после того как я выкинул с зеркала диск 2 и добавил туда диск 4 стоит воспользоваться этой командой? Признаюсь я не совсем понимаю ее смысл.

Перенести я хочу систему находящуюся на зеркале с действующих 2=х винтов на новые 2.

[El Scorpio]

Но есть опасения что после ребута может не загрузится винда и вот от куда опасения в статье http://habrahabr.ru/company/first/blog/241333/ в коментах написано что нужно запустить команду «bcdboot c:\windows /s c:» и она скопирует системные файлы на 2-й диск. В моем случае после того как я выкинул с зеркала диск 2 и добавил туда диск 4 стоит воспользоваться этой командой? Признаюсь я не совсем понимаю ее смысл. »

Смысл команды совершенно иной.
Изначально Windows создаёт загрузочный раздел 100 Мб
Затем при преобразовании диска в программный RAID вы создали "зеркало" только для диска C: , а раздел начальной загрузки остаётся в единственном экземпляре.

В таком случае есть два варианта:
1) перенести файлы начальной загрузки в массив диска C: , чтобы не использовать раздел начальной загрузки - это было сделано в статье Хабра
2) создать на втором диске отдельный раздел и выполнить преобразование раздела начальной загрузки в "зеркало" - это сделали вы на диске №4

То есть сейчас вам просто нужно проверить, что компьютер может загружаться с диска №4

[andragen]

По загрузочному понял либо делать зеркало раздела на 100Мб либо копировать файлы загрузки на раздел диска С
Пока сервер не рубился 2-ые сутки после того как выкинул с зеркала диск 2 и добавил диск 4.
Я пока проверил под виндок программой виктория диск 2 и на нем нету бэдов, перед добавлением в зеркало диск 4 я так же проверял и он был в норме, после добавления в зерколо куча медленных сектаров. Пока диск 0 решил не выкидывать с зеркала.