[Blast]

Управление дисками в Windows Vista - последняя треть статьи примерно.

И опасно ли это для операционки? »

Если делать средствами Windows, то нет, если сторонними программами, то гарантий нет, что будет все нормально. Вместе с тем, сторонние программы типа Acronis Disk Director имеют на борту больше функционала и позволяют управлять разделами более гибко.
В вашем случае, если вы хотите объединить с диском С не весь диск D, а только его часть, то вам нужно сначала "откусить" от диска D часть, за счет которой впоследствии вы и сможете расширить диск С. Все это также описано в статье выше.