[dascon]

1. Программа должна быть, так сказать, расчитана на это. Например, MS Office, WinAmp, ACDSee хранят настройки в подпапке профиля пользователя. Некоторые проги позволяют использовать общие настройки для всех пользователей (Opera).
2. Есть такая вкладка в свойствах папки - Безопасность. А вообще, у каждого пользователя есть своя "Мои документы", поэтому без надобности не стоит создавать им лишних.
3. Через ту-же "Безопасность", например, можно...

P.S. ответы далеко не полные, надеюсь кто-нибудь еще дополнит