[lxa85]

sacredboy, Где-то в Windows была похожая тема, Сколько надо разделов на жестком диске.
Там же в частности обсуждалось как их следует распологать. Многое зависит от потребностей, и от кол-ва дисков.
Так например недавно столкнулся с технологией LVM, являющиеся уровнем адстракции, но позволяющая гибко работать с разделами. Понравилась. В новном сервере найдет себе применение.

Имеет ли значение куда определять раздел, в начало или в конец? »

Если правильно помню, в начале скорость доступа к данным выше. Поэтому в частности раздел /swap советуют распологать поближе к началу.

И еще, какие разделы должны быть основными (primary), а какие логическими (logical)? »

ИМХО primary это / (root), swap. Все остальное logical /var /usr /usr/local /home и т.д. и т.п.