[juk]

Drongo,

Хотя, когда копируется скрываемая папка с содержимым, копируется не только папка, но и скрытое содержимое. »

Чесно? Не понял.
Если ты имел в виду что файлы которые необходимо спрятать, копируются в папку, а не переносятся, то их можно туда и перенести удерживая Shift.

И было бы здорово, если бы папка Сейф создавалась не рядом с программой, а можно было бы указать свой, пользовательский путь к месторасположению этой папки. »

А смысл какой? Всё равно чтоб запустить программу, к ней нужно как-то добраться.
Можно спрятать прогу глубоко в недра компьютера, но всё равно придётся создать ярлык на рабочем столе для её запуска, или всё время добираться до программы. Папка-то только создаётся возле программы, а вот куда она прячется, это уже вопрос.
Хотя я скорее всего тебя не понял.