[Antech]

noisexoma
Разбить можно из-под чего угодно, но Винда смонтирует только первый раздел (sic!).
Чтобы в Винде иметь на флешке несколько разделов, применяют специальную утилиту из комплекта флешки или с сайта влешковендора, которая позволяет сконфигурить флешь как бы как несколько девайсов, тогда каждый девайс будет монтироваться Виндой нормально, но на каждом из них все равно будет только один раздел, доступный Винде.
Линуксу по-барабану, он монтирует флешку с любым количеством разделов.