[DmB89]

1ый Диск индифицируется как Tertiary/Master HDD а 2ой как Quaternary/Master HDD »

Tertiary - третичный, Quaternary - четвертичный. Словарь английского языка. Означает это, что устройства подсоединены к третьему и четвёртому каналам SATA соответственно. То, что они все Master - это норма для SATA дисков, у них вообще нет разделения на Master/Slave, а оставили обозначение скорее всего для совместимости.

по рекомендованной d0h скорость вращения шпиндиля в половину меньше. Это приведет к снижению скорости в 2,5 раза. »

Это где же такое написано? Ссылочку можно? Насколько я знаю, скорость вращения шпинделя постоянна, а меняется только алгоритм работы привода головок. Подробнее можно прочесть здесь. В своё время снизил до минимума шум IBM-овского диска, и вообще не заметил снижения производительности!