[Sham]

character-sets-dir это директива из my.cnf, где указан путь к папке с наборами символов, которые юзает MySQL. Я предположил, что не хватает нужных... (не знаю)

для каждой таблицы уже поставил utf8_unicode_ci »

afaik текст в таблицах остается в прежней кодировке. afaik когда меняется кодировка таблицы - это значит, мы говорим мусклу, какую кодовую страницу юзать для обработки текста или вывода (кодировка самого текста при этом не меняется)... кодировка таблиц должна соответствовать кодировке текста (иначе, например, будет неправильная сортировка, или поиск)...
попробуйте вначале скрипта выполнять запрос

Код:

SET NAMES <кодировка>

например SET NAMES cp1251 - для кириллицы... и ставить другие кодировки