Demiurg
Во-первых, при первой возможности советую обновить систему до 5.2.1-RELEASE. Все-таки, еще один шаг вперед.
Во-вторых, есть ли какое-либо упоминание о SATA в dmesg?
P.S Только что нашел информацию о том, что проблемы, бывшие с поддержкой SATA в 5.1, решены в версии 5.2
http://www.polus.com.ru/news4/1074074648.html и более подробная информация об этом на сайте FreeBSD
http://www.freebsd.org/releases/5.2R/errata.html