[lev1]

смогу ли я выпаяв флешки из рабочего аппарата нормально их прочитать программатором »

Конечно. И сравнить тоже. Видно с программатором вы не работали.

нет ли там бита защиты от чтения? »

А скажите, как их тогда читать и какой в этом смысл? Программаторы считают всё, вместе с защитой.

Какая температура для данных в флешках безопасна? »

Мануал на микросхему от производителя, там все ответы с графиками и таблицами.

P.S. Не думаю что следует покупать программатор из-за одного случая.