[Котяра]

+ NTFS является отказоустойчивой системой. В отличие от FAT32, программа "check disk" запускается только при опасности для данных.
А FAT32

выпадает в проверку диска после не корректного выключения компьютера »

+ NTFS поддерживает функции безопасности Windows XP
- NTFS нельзя использовать в DOS/Win95/Win98/WinME. Хотя при наличии диска Windows PE архаичная дос-дискета не нужна
- Менее быстрая (хотя я этого не заметил, я работал только в NTFS и быстро)
Короче говоря,

что лучше, быстрее и надежнее »

На первый вопрос ответа не существует
На второй: не знаю.
А вот на третий отвечаю с уверенностью:
NTFS