Естественно пробовал. Но установка идет от пользователя с админскими правами. И проблема так и остается.
Нашел тут одно
решение .
Я интегрировал hotfix'ы в дистрибутив с помощью nLite, а он похоже не правильно интегрировал Windows-Installer. Завтра попробую переустановить его вручную.
Если у кого есть еще мысли пишите