[Alexis13]

vserd,
Это понятно, что после примения аддонов некоторые файлы были изменены, я когда фильтровал одинаковые, ставил в условие и размер файлов, конечно MD5 не расчитывал, но в списке у меня вышли и одинаковые файлы, но с разным размером.

P.S. Разобраслся почему такая байда вышла, все дело в двух файлах, но зато каких Driver.cab и Sp3.cab, вместо того чтобы для 2-й и 3-й винды использоваться по одному разу, они использовались оба раза, причем по содержимому они одинаковые, после применения аддонов каждый раз эти файлы перепаковывались и даты файлов внутри оказались разными, хотя содержимое одно и тоже, ну а CDImage посчитав MD5, нашел их разными из за разных дат внутри cab архива, и забубенил в образ в обоих дистрибутивах.