[Drongo]

AnGI_Burn, Значит эти dll'ки были изменены или взяты из другого дистрибутива, или ещё как, контрольная сумма их совпадает, и копирование и распаковка произведена, а вот в setuperror.log информация о том, что файл не имеет цифровой подписи
Читать тут раздел modifyPE Выдержка из статьи Vadikan'a

Если вы измените системный файл при помощи редактора ресурсов типа ResEdit или Resource Hacker, и включите его в дистрибутив, то во время инсталляции системы неизбежно получите ошибку копирования. Программа установки Windows проверяет контрольную сумму всех копируемых файлов, и в случае несовпадения отказывается копировать. Утилита ModifyPE корректирует контрольную сумму, и как следствие файл воспринимается как родной.

Несмотря на то, что программа установки Windows допустит копирование файла, по окончании установки в файл setuperr.log вносится запись о том, что файл не имеет цифровой подписи Microsoft. Возможна ситуация, когда при проверке целостности файлов Windows захочет восстановить оригинальный файл. Отключить проверку системных файлов можно при помощи nLite.

Ну может я и не прав, и это моё мнение, тогда более опытные меня поправят.
Хотя может действительно, какие-то dll'ки случайно удалились, или те службы, которые ссылаются на эти dll'ки...