[BarNet]

На примере программы MySQL - Front. Подключись к серверу на Win машине, выбери нужную базу и сделай експорт в sql. Потом просто импортируй на Linux машыне. Там нету ничего сложного. Или же штатными средствами MySQL команда mysqldump.
для експорта,

Код:

mysqldump -uLOGIN -PPORT -hHOST -pPASS DBNAME > dump.sql

для импорта.

Код:

mysql -uLOGIN -PPORT -hHOST -pPASS DBNAME < dump.txt

P.S. Пользуйтесь поиском не только по форуму но и по сайту. Вот то что вам поможет MySQL - На OSzone.net

[dmitryst]

dihlof0s, есть MySQL Administrator, на их же сайте, бесплатен. Я думаю, за пару минут разберётесь (backup/restore)

[dihlof0s]

спасибо!

[dmitryst]

dihlof0s, не "спасибо", а нажмите "Полезное сообщение" того автора, чей пост вам реально помог
Не забудьте отписаться, как все прошло (все ли таблицы нормально перенеслись, не слетела ли кодировка и т.п.)