[Ven]

1. У меня долго на терминальном сервере использовалась только одна программа, которая запускалась с помощью "Среды". Но При закрытии этой программы сеанс сам завершался. Не знаю почему у Вас сеанс сам не завершается Если Вы уверены что Вам нужен именно такой режим работы, то ищите решение проблемы почему сеанс сам не завершается.

2. Ярлыков не видно именно потому, что не запущен explorer.exe - именно он и отображает рабочий стол. Это нормальное явление.

3. Как вариант, можно дать пользователям полноценный рабочий стол (не использовать "Среду"), но ограничить права пользователя с помощью GPO. Это более правильный способ с точки зрения прав доступа, безопасности и т. п. У меня сейчас так сделано. Если интересно - можем пообщаться подробней в ICQ.