[volk1234]

DyadyaGenya,
я кода пример аддона netlook писал для руководства столкнулся с похожей проблемой,
мне здесь помогли:
volk1234
Поскольку удаление папок осуществляется через advpack, то вместо инструкции Run нужно использовать RunPostSetupCommands
Run обрабатывается только через setupapi http://forum.oszone.net/post-757725-446.html

и в руководстве по созданию аддонов в примере создания аддона Netlook http://forum.oszone.net/post-762548-474.html
посмотрите про деинсталяцию, я также споткнулся на удалении папок, хотел удалять как по инструкции, а потом использовать более продвинутые методы.
Если вкратце для удаления папок пользуйтесь RunPostSetupCommands вместо Run и Удаляйте структуру папок снизу предварительно удалив файлы.

Код:

Имеем структуру папок:
Folder
 -subfolder1
     --subsubfolder1
 -subfolder2

Условным кодом удаляем:

Del subsubfolder1
Del subfolder1
Del subfolder2
Del Folder