[Admiral]

или посредством стороннего, программного обеспечения? »

Для ОС от Microsoft придётся воспользоваться внешними программами. Например bootpart

1)Нужно сохранить его на Иде винте.
2)На САТА винте в файле boot.ini прописываеш

Код:

multi(1)disk(0)rdisk(0)partition(1)\bootsect.win="Windows" /noexecute=optin /fastdetect

к уже написаному

Код:

multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Windows" /noexecute=optin /fastdetect

bootsect.win - имя сектора полученого от BootPart
Насчёт multi(1) то надо знать какой контроллер на материнке первый определяется, так как когда САТА отключиш ИДЕ станет О, но когда назад её включиш она станет О.

Если с BootPart не получится то рекомендую с ЛайвСД линукса загрузится и ввести такую не хитрую команду

Код:

dd if=/dev/раздел_с_Windows of=/bootsect.win bs=512 count=1

Настоятельно рекомендую проделать всё выше описаное на Виртуальной ОС, а если такой возможности нет то тогда зарезервировать все данные прежде чем приступать к работе.