SilentSpider

Тэкс.
Некий вариант придумался. Извратный, через анус. И тем не менее.
1. Загружаем файлы в Adobe Audition
2. Делаем Group normalise
3. делаем копию одного из файлов, инвертируем. Effects->Inverse.
4. загружаем оба файла в multitrack, в новый трек делаем микс В этом треке видим начало первого несовпадения.
5. Удаляем копию, ищем по пикам длину несовпадения.
6. Создаем копию исходника, вырезаем несовпавший кусок, инвертируем... и так до полного удовлетворения.