[BigMax3]

У меня сделано следующим образом:
после установки голого Windows'a запускается .cmd файлик (взят на этом же форуме)

Код:

for %%i in (C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z) do
if exist %%i:\USBDRIVE set USBDRIVE=%%i: 
REG ADD "HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\Environment"
 /v PENDRIVE /d %USBDRIVE% /f

т.е. ищется носитель на котором в корне присутствует файл USBDRIVE, и этому носителю присваивается переменная %USBDRIVE%
с прописываением в регистр.

Соответственно в PRESETUP.INI первой строчкой идет
RootInstallDir=%USBDRIVE%