[amel27]

ProcInf
в продолжение CMD-варианта...

как в один проход отсортировать файлы

- отобрать список всех файлов (DIR /B *.*) во временный текстовый файл;
- на основе общего списка имен и списка шаблонов построить списки имен для каждого типа файлов (используя GREP или штатный FINDSTR);
- отработать в цикле все полученные списки отсортированных файлов.

как пропускать уже отсортированные файлы

отсортированные или скопированные?... если первое, то по наличию в списке, если второе, то по наличию файла в целевом каталоге (IF EXIST)

как исключать повторяющиеся файлы

аналогично предыдущему... если разные файлы могут иметь одинаковое имя, то придется по ходу копирования переименовывать.

и вообще хочется побольше опыта приобрести по данной проблеме.

сначала нужно иметь четкую постановку задачи