e-not1989
Запуск cleanup.cmd производите из RunOnce,
ПОСЛЕ установки офиса.
В Вашем же случае файлы с дистрибутивом офиса удаляются до начала установки, т.к. cmdlines.txt отрабатывает
ДО RunOnceEx.cmd.
Обратитесь к учебнику -
Процесс установки по минутам