VelDmi
CMD ругался на кавычки после ">", так с кавычками вроде работает:
Код:

$CutDir = '"' &@ScriptDir& '\CutDir' & '"'
$exfile = '"' &@ScriptDir& '\fsum.exe' & '"'
$mdfile = '"' &@ScriptDir& '\sums.md5' & '"'
$erfile = '"' &@ScriptDir& '\fsums.err' & '"'
RunWait (@COMSPEC & ' /c ' & '(' & $exfile & ' -c -r -d' & $CutDir & ' ' & $mdfile & ' >' & $erfile & ')', @ScriptDir)