[Erekle]

В Комодо в настройках ничего не меняли?
Если можно, лог от ProcExplorer'a (он что, запускается во время "замораживания?) и от этой программы (scan > save log). Может что-то да удастся уловить.

так и диспетчер не отрывается в это время. а если открыт, то "замерзает" позже появляются только дополнительные svchostы от network.

Появляется после преодоления застоя? Если во время его, но запоздало, то может и колонку CPU посмотреть, если меняется.
Ещё одно... Если не в "это время", тогда следует "подкараулить" до того.
Можно вывести журнал или соответственное окно файерволла на весь экран, или включить наблюдение этой программой (не знаю, как будет с GPRS, но по сети ведь тоже выходили), - а потом связаться с интернетом, и посмотреть, нет ли чего странного при вхождении в сеть. Диспетчерами процессов тоже можно попробовать.