Попытайтесь поискать по коду что-то в роде:
Код:
mysql_query ('set character_set_client=\'cp1251\'');
mysql_query ('set character_set_results=\'cp1251\'');
mysql_query ('set collation_connection=\'cp1251_general_ci\'');
Не факт, конечно, что будет использоваться mysql_query, но вот "set ..." - корень всех бед. Возможно установка опций, как это приведено и выше, используется при каждом коннекте к базе в виде установок кодировки клиента и прочего.
