[vovan]

А когда такие траблы происходят? А диски в NTFS? А траблы происходят только под админом? После переустановки какое время Винда пашет? Пусть кто-нибудь из вас после переустановки поработает временно без сети и без И-нета. Проги ставит пусть с задержкой, следя за компом.
Блин, надо отследить, что за фигня удаляет  \windows, но штука это, видно, серьёзная! Попробуй запустить Dr.Watson и еще работать с включенным диспетчером задач, следя за процессами, или каким-нибудь файл-монитором. Еще попробуй к любой папке в  \windows отменить полный доступ всем: и системе, и админу, - только чтение (правда это срабатывало на диске с NTFS). Если и после этого что-то удалит всю папку - кого-то вы страшного пригрели, ребята.