[-lex-]

Решение оказалось довольно простым. В VirtualDub меню Streams -> Stream list -> правой на потоке и выбрать Interleaving -> указать значение параметра Delay audio track by, здесь надо указать насколько расходятся видео и звук. Если звук уходит вперед - значение положительное и наоборот. В File -> File information узнаю точнуюю продолжительность видео и звука, высчитываю между ними разницу - это и есть значение задержки. Правда не знаю сработает ли этот способ при прогрессирующей ассинхронизации.