1-назначаешь роль DNS, затем назначаешь роль КД серверу
или
2-используешь команду DCPROMO, и она делает все автоматически
В 2003 винде настройка ДНС производится мастером (один из вариантов), где отвечаешь на вопросы мастера
Второй же сервер надо ввести в домен, присвоить ему роль КД, установить ДНС без загрузки или установки зон, т.к. после репликации (которая выставится автоматически) будут все зоны (настройки ДНС) скопированы на новый сервер
Более подробно
тут