Для добавления и применения твиков реестра рекомендую ознакомиться со статьей
Tвики реестра.
Из которой следует, что твики ветви HKCU (Current User) лучше всего применять на T-13 до первого входа пользователя в систему, а настройки HKLM (Locale Machne) в последнюю очередь, так как если применить их рано, не все из них срабатывают.
По поводу приминения твиков к уже установленной системе. Для некоторых достаточно "применения", некоторым необходима смена сеанса ("перелогон"), остальные требуют перезагрузки.