[EgOrus]

не уверен что это намного лучше выложенного просто скрипта, в скрипте можно просто делать описание где какие папки должны лежать, в принципе Source: и DestDir: это самые основы при работе с Inno скриптами, думаю проблемм с расположением не возникнет, сами же "сырцы" программ качать бессмысленно, т.к. они имеют свойства обновляться...
Продложая твою мысль может имеет смысл выкладыть вместе со скриптом голую структуру папкок без файлов, которую уже каждый будет наполнять для себя сам.