[Unter]

Можно в имени файла проекта указывать идентификационный номер, а скрипт будет его обрабатывать в порядке нумерации. Хорошая идея, но я как-то не могу сходу представить ее техническую реализацию.

Сложность может возникнуть только с определением установленных апдейтов: где хранить информацию в реестре или еще где нибудь, а в обновления можно вкладывать сопроводиловку с которой и будет сравниваться. Это в том случае если все апдейты необходимо обрабатывать в порядке выпуска, а если порядок не важен, то еще проще.
А вообще командный процессор в NT-шках позволяет многое сделать. Я как-то извращался даже на тему сравнения даты файлов с определенной датой. В крайнем случае можно использовать скрипты. Правда я сейчас до конца октября в отпуске, поэтому заходить на форум буду редко.