[xoomer]

treiber

Хотя прошел регистрацию (ввел фамилию и емайл адрес), но так и не смог скачать Treal version - Advanced System Optimizer.

Ты качай там где есть на ссылке окончательный файл установки/архив. Также поддерживаю ScorpionXXX.

Там все также просто как и в дефрагментации файловой системы или можно по незнанию что-либо неправильно сделать?

В принципе да. НО!!! Если при дефраге диска можна нажать чудесную кнопычку RESET и ничего страшного не будет в 99,9% случаев, то здесь очень велика вероятность того, что Win не загрузится. И при дефраге реестра, впрочем как и диска лучше ничего не юзать - последствия могут быть плачевными. Также делает дефрагментацию реестра программа WinRescue.

А имеются ли в принципе программы, которые позволяют (при необходимости) визуализировать и управлять файловой системой (FAT, FAT32, NTFS )

О программах на Win я не слышал, а вот на Linux - есть, но там другие файловые системы - JFS, XFS и т.д.