[Lebedev]

Справился. Никак не мог вырваться и написать как.

Спасибо ShaddyR, натолкнул на верный путь.

По автодетекту винты определяются именно LBA (один с неверным размером). Именно это сбило меня с толку.
А если ставить авто, они определяются с верным размером и режимом доступа CHS.

Но грузится система не хотела. Закрались подозрения что виноват винт, на котором стоят системы. Думаю, что-то с таблицей разделов или еще с чем... В общем переписал загрузщик на 2й винт и стал грузится с него. Удалось. Теперь загрузщик на 1 винте, передает управление на оси на 2м винте.

Изврат, но ковыряться с винтом влом.