[radical]

Судя по смарту сам диск, как железка, здесь не при чем. Бешеные показатели Raw read error rate и Seek error rate, судя по всему, для Сигейтов - норма. У меня на работе много Сигейтов и у всех такая фигня, но все, как ни странно, нормально работают.
По сему, не вижу смысла нести диск обратно. Мне кажется просто FAT дуреет от такого объема, здесь я согласен с SandroK.
Не совсем понимаю на сколько логических разбит твой диск.