[vek]

ProkVS
Ну так возьми любой инсталятор Inno например. Ну а проблема все равно останется. Инсталятор зажмет все папки в один *.exe и после каждого обновления придется пересобирать инстал заново.
Вот только не пойму, зачем тебе такой геморой. Запускал-бы WPI прям с диска.
У меня вот тоже винда на одном, программы на другом. Поставил Виндоус. Потом ставлю диск с софтом, а там на авторан прописан батник, который по очереди запускает перепакованный софт. И обновляется легко и не привязан к системе, а то вдруг когда-нибудь не будет под рукой именно второго диска, что делать будешь? Тебе будет система говорить: - "вставь диск", а его тю-тю!!