[DmitryOlenin]

melato
Это уж как вам удобно...
Я написал скрипт на AutoIt, который красиво ребутит с предупреждением.
До того ребутил стандартной виндовой функцией(в этом случае выдается страшное предупреждение, бывает, что люди пугаются).

У меня ребут идет после установки, но до загрузки раб. стола. Возможно есть смысл поставить вызов из одного батника другого, а там уже задержку и ребут. Тогда будет перезагрузка после отображения раб. стола. Это может снять некоторые проблемы.