[kim-aa]

Ситуация описана многократно (и в этом форуме тоже) - хреновая работа NetBIOS в мультисегментных сетях.
1) Вариант (по науке) - Поднятие WINS серверов в обоих сегментах, и настройка их синхронизации. Wins можно поднять на SAMBA (даже лучше в случае Workgroup).
2) Вариант (шаманический, но 100% рабочий) - Поднятие домена в основной сети и ввод в домен хотя бы 1й станции из сети филиала.

HOSTS прописан

NetBIOS имена прописываются в LMHOSTS

3) А да совсем забыл, перевод 1с- сервер в терминальный режим. Тогда пользователи могут подключаться по IP. Кстати, и быстродействие резко вырастет.