[i5gh]

На Мой взгляд 4 если винт 120 и более , если 40 то однозначно 2. У меня 160 Первые 2 небольшых 5 Gb под 2 системы с софтом, 3 -й Бэкап + Дистрибутивы софта 20 Gb, 4 Всё остальное, музыка фильмы и т.д .
Система только NTFS во первых надёжность(завалить тяжело сам экперименты проводил) , в отличие от FAT, ну  да чуть помедленнее NTFS чем FAT но это не критично.
Восстановление системы не составляет труда.
А на счёт секюрити, дома в это не проблемма.А вообще если есть локальный доступ к машине то ни а какой безопасности речи быть не может.