[Komintern]

Если это будет DNS, FTP или HTTP-сервер, то никаких проблем не будет. Если сервер печати, тоже. В качестве файл-сервера поднимать линуху тоже стоит (предварительно ознакомиться необходимо с SAMBA).
Имхо, в любом случае линукс-сервер лучше чем виндовз-сервер.