[ni4]

При удалении таблицы разделов, а она находится в самом первом секторе ваше флехи, гарантированно пропадут все разделы и соотвественно лог диски. WinHex я предложил потому, что пользуюсь им сам, но можно и любым другим редактором дисков. Открываете вашу флеху как физический носитель, забиваете нулями 1 сектор, сохраняете изменения. После этого флешка станет "неразмеченной/неотформатированной областью". Далее стандартными средствами винды создаете 1 раздел и форматируете в фат32.
Возможные проблемы:
1. Не все редакторы дисков могут работать с флехами. WinHex 12.35 может точно, проверено мной.
2. Винда может отказаться форматировать флеху, хотя это и маловероятно и скорее всего не так, но все таки... В этом случае попробуйте утилиты сторонних разработчиков.
Больше ничего на ум не приходит