[EgOrus]

biork
Чтобы понять почему не работает пришлось поставить 3DMark2001, ставится он почти также как 2003, так вот дело в том что, твое условие If WinExists проверяется на стадии копирования файлов и декомпрессии текстур, естественно такого окна нет, и переходим к следующему условию ElseIf WinExists такого окна тоже нет и завершаем скрипт.
Нужно добавить перед проверкой условий, ожидание завершения процесса копирования, чтобы в момент проверки условий либо то либо то окно успело появиться, сделать можно по разному например вот так:

Код:

ControlClick("InstallShield Wizard", "Start Copying Files", "Button1")
;здесь может появиться окно ввода серийного номера, если программа ставится впервые
WinWait("Texture Conversion", "Setup Status")
WinWaitClose("Texture Conversion", "Setup Status" , 180)
sleep (1000)
IF WinExists ("InstallShield Wizard", "MadOnion.com Registration") then
WinActivate("InstallShield Wizard", "MadOnion.com Registration")