Привет!
Привожу пример своего файла, у мня все работает:
Код:

IF EXIST %WINDIR%\CMDOW.exe cmdow @ /HID
shutdown.exe -r -f -t 30 -c "Don`t panic. The system will reboot in 30 seconds."
del /S /Q "%AllUsersProfile%\Главное меню\Windows Update.lnk"
del /S /Q "%AllUsersProfile%\Главное меню\Выбор программ по умолчанию.lnk"
del /S /Q "%AllUsersProfile%\Главное меню\Каталог Windows.lnk"
del /S /Q "%AllUsersProfile%\Главное меню\Программы\Windows Messenger.lnk"
del /S /Q "%UserProfile%\Главное меню\Программы\Удаленный помощник.lnk"
del /S /Q "%AllUsersProfile%\Рабочий стол\Adobe Reader 7.0.lnk"
del /S /Q "%AllUsersProfile%\Рабочий стол\Nero StartSmart.lnk"
del /S /Q "%UserProfile%\Главное меню\Программы\Автозагрузка\Total Commander.lnk
del /S /Q "%UserProfile%\Главное меню\Программы\AkelPad.lnk
del /S /Q "%AllUsersProfile%\Рабочий стол\Light Alloy.lnk
del /S /Q C:\RunOnceEx.cmd