[severmoroz]

Не факт, что Иллюстратором текст из пдф откроется правильно. Там могут быть такие же кракозябры, которые будет проблематично заменить средствами Иллюстратора, нежели средствами Акробата
Вообще, методы решения проблем пдф существуют. Но чтобы сказать конкретный метод решения, необходимо более подробное описание конкретной проблемы .
По порядку:
По поводу шрифтов. Чтобы не писали кульные хацкеры, ни в коем случае нельзя менять ключи реестра 1252 на 1251. Это в корне не правильно. Лечить нужно не реестр, а сами шрифты. Точнее, пользоваться правильными шрифтами, т.е. шрифтами с современной спецификацией (например, шрифты компании Паратайп: www.paratype.ru). Шрифты старой спецификации необходимо, как уже написал, лечить. Для этих целей лучше всего воспользоваться утилитой Фигурнова. Найти её можно на www.prodtp.ru. Правда, файловый архив работает только по выходным и праздничным дням. Там же можно почитать, почему нельзя менять 1252 на 1251.
Теперь, если пдф уже создан, а шрифт (неправильный) внедрён, можно попробовать с помощью Enfocus PitStop поменять его на правильный. Естественно, устанавливать PitStop нужно на Acrobat Professional, а не на Acrobat Reader.

А вообще, в технологии пдф нет ничего сложного, и, как правило, все такого типа проблемы возникают из-за hands.sys. Уже сколько переговорено... что надо избегать использование системных шрифтов при создании пдф... лучше вообще пользоваться Type1 или OpenType шрифтами.... и т.д.

Используйте правильные шрифты - и больше половины проблем исчезнет.