sub
1) В тех случаях php - скрипты изначально не показывались. А в Вашем, насколько японимаю, то показываются, то нет???
2) php, или mod_php?
3) Что будет при попытке в консоли задать команду
Код:

php путь_к_файлу/index.php
4) Ну и так, на всякий случай:
Код:

cat httpd.conf |grep php
5) делаем test.php
Код:

<?php
phpinfo();
?>
и пробуем запустить его через апач и из командной строки.
ждем результатов.
а вот хотелось бы мне знать, зачем народ ставит второй апач? острых ощущений хочется? 