[Skaarj]

а почему собственно без GUI ???

Here’s an example how to attach a photo and a TrueType font to the output file: $ mkvmerge -o output.mkv -A video.avi sound.ogg −−attachment−description "Me and the band behind the stage in a small get-together" −−attachment−mime−type image/jpeg −−attach−file me_and_the_band.jpg −−attachment−description "The real rare and unbelievably good looking font" −−attachment−type application/octet−stream −−attach−file really_cool_font.ttf

картинка формата jpg, gif, png, bmp разрешение любое, размер тоже (но чем меньше тем лучше), если картинок много во вложении то для эскиза назови одно из них cover*.*, если картинки с таким названием нет то в качестве эскиза будет использовано последнее вложенное изображение.